Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmco5aQ9D9D5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmco5aQ9D9D5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms