Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms