Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms