Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efhd1Q9D4J1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms