Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms