Protein–RNA interactions for Protein: Q9D443

4933415A04Rik, RIKEN cDNA 4933415A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933415A04RikQ9D443 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
4933415A04RikQ9D443 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms