Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pramef12Q9D2F1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pramef12Q9D2F1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms