Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms