Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snu13Q9D0T1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snu13Q9D0T1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms