Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pbdc1Q9D0B6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms