Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms