Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
3110001I22RikQ9CZ70 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms