Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrs1Q9CYH6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrs1Q9CYH6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms