Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2fQ9CY34 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms