Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx7Q9CY18 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx7Q9CY18 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms