Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pfdn1Q9CWM4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pfdn1Q9CWM4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pfdn1Q9CWM4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pfdn1Q9CWM4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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