Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930535I16RikQ9CUI2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930535I16RikQ9CUI2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms