Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms