Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chchd1Q9CQA6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Chchd1Q9CQA6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chchd1Q9CQA6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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