Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms