Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Use1Q9CQ56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Use1Q9CQ56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms