Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1ip1Q9CQ20 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms