Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GpnmbQ99P91 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms