Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp1b1Q99LU0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp1b1Q99LU0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms