Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf19Q99KP6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms