Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pacsin3Q99JB8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin3Q99JB8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms