Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd1Q99J36 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms