Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms