Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb6Q922F4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms