Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BbxQ8VBW5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BbxQ8VBW5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms