Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms