Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrit1Q8K099 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrit1Q8K099 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms