Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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