Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa5Q8C7G5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa5Q8C7G5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa5Q8C7G5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa5Q8C7G5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa5Q8C7G5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa5Q8C7G5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa5Q8C7G5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms