Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc90bQ8C3X2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms