Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms