Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ScocQ78YZ6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms