Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms