Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cyp2d40Q6P8N9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp2d40Q6P8N9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms