Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capn11Q6J756 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms