Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nop58Q6DFW4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop58Q6DFW4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms