Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pkp4Q68FH0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pkp4Q68FH0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp4Q68FH0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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