Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprdQ64487 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PtprdQ64487 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprdQ64487 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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