Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zfp248Q640N4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zfp248Q640N4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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