Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn3Q62471 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms