Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms