Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms