Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Stxbp3Q60770 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms