Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mkrn3Q60764 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mkrn3Q60764 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms