Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trdv4Q5R1A3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trdv4Q5R1A3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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